Deciphering the genome modality change through data-driven phase portrait reconstruction

About this project

Japan Grant Number
JP23H04288
Funding Program
Grants-in-Aid for Scientific Research
Funding organization
Japan Society for the Promotion of Science
Project/Area Number
23H04288
Research Category
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type
  • Single-year Grants
Review Section / Research Field
  • Transformative Research Areas, Section (III)
Research Institution
  • Kyushu University
Project Period (FY)
2023-04-01 〜 2025-03-31
Project Status
Granted
Budget Amount*help
10,400,000 Yen (Direct Cost: 8,000,000 Yen Indirect Cost: 2,400,000 Yen)

Research Abstract

申請者は、クロマチンの組成が規定する分化時の遺伝子の選択的発現機構の解明のため、少数細胞エピゲノム解析技術ChIL-seqを用いて、組織の再生や老化といった質的帰結を与えるクロマチン動態の解明を目指している。参画した公募班前期では、単一細胞オミクスデータからゲノム様式の質的理解の手段を得るため、単一細胞クロマチン状態態変化(クロマチンフロー)の計測と、データ駆動的な位相図の再構成を目標に掲げこれを達成してきた。次なる課題として、本計画では、再構成した高次元の位相図を研究者の直感の働く形で可視化し、対象の理解を得るモデル構築に至る方法論の確立を目指す。

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