Gene expression mapping of esophageal cancer microenvironment by spatial transcriptomics

About this project

Japan Grant Number
JP20K09080
Funding Program
Grants-in-Aid for Scientific Research
Funding organization
Japan Society for the Promotion of Science
Project/Area Number
20K09080
Research Category
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type
  • Multi-year Fund
Review Section / Research Field
  • Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research Institution
  • Kyushu University
Project Period (FY)
2020-04-01 〜 2023-03-31
Project Status
Completed
Budget Amount*help
4,420,000 Yen (Direct Cost: 3,400,000 Yen Indirect Cost: 1,020,000 Yen)

Research Abstract

癌の浸潤・転移機構については、腫瘍微小環境が大きな役割を果たしていると考えられているが未だ十分に解明されていない。今回、新技術”Visium”(10X genomics社)により遺伝子発現情報をその位置情報を維持したまま、単一細胞レベルの遺伝子発現やタンパクの解析が可能となった。本研究ではその新技術を利用することで食道癌微小環境に対し、従来の病理形態学と密に情報をマッチさせた遺伝子発現地図を作成し、腫瘍微小環境における機能をマッピングすることによって、微小環境の機能に関する理解を深め、癌の浸潤・転移機構等の解明を目指す。

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