データ駆動的な位相図の再構成によるゲノム様式変化の理解

About this project

Japan Grant Number
JP21H05755
Funding Program
Grants-in-Aid for Scientific Research
Funding organization
Japan Society for the Promotion of Science
Project/Area Number
21H05755
Research Category
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type
  • Single-year Grants
Review Section / Research Field
  • Transformative Research Areas, Section (III)
Research Institution
  • Kyushu University
Project Period (FY)
2021-09-10 〜 2023-03-31
Project Status
Completed
Budget Amount*help
10,400,000 Yen (Direct Cost: 8,000,000 Yen Indirect Cost: 2,400,000 Yen)

Research Abstract

本計画は、クロマチンの位相図再構成理論の構築と実データによる検証を主軸として遂行する。とりわけ、クロマチン・フローと名付けた、時間情報の計測指標の開発に注力する。フローを産み出す背後のダイナミクスの定性的情報を代表するような「要点」を取り出し、パッチワークで繋ぎ合わせ、データ点上の流れとして擬似的モデルを作成する。さらに、クロマチンへの摂動が与える細胞・組織レベルの表現型を仮想的に評価できる位相図の構築を行う。解析対象は、マウス骨格筋組織の分化・再生モデルや、がん組織を計画している。

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