エピスタシス尺度に基づくリンケージ同定手法の提案
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- エピスタシス シャクド ニ モトヅク リンケージ ドウテイ シュホウ ノ テイアン
- Proposal of a Linkage Identification Method Based on Epistasis Measure
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遺伝的アルゴリズム（Genetic Algorithm ，GA ）はビルディングブロックを交叉により組み合わせることで効果的な探索を実現しているが，そのためにどの遺伝子座がビルディングブロックを構成しうるのかを調べるリンケージ同定が重要となる．リンケージ同定に関してはこれまでにも確率モデルに基づく方法や非線形性もしくは非単調性を基に判断する手法が提案されている．本論文では，遺伝子座間に存在する非線形性を検出することでリンケージ同定を行うLINC （Linkage Identi cation by Nonlinearity Check ）を発展させ，それぞれの遺伝子座のペアに対してエピスタシス（非線形性）尺度を定義し，それに基づいてリンケージの同定を実現する手法を提案する．
Genetic Algorithms realize e ective search by exchanging building blocks through genetic recombinations.To realize e ective genetic search,linkage identi cation becomes important which detects a set of loci tightly linked to form a building block.Several methods are already proposed to identify linkage such as linkage learning algorithms based on probabilistic models and linkage identi cation procedures based on nonlinearity or non-monotonicity detection. In this paper,we extend the Linkage Identi cation by Nonlinearity Check (LINC)which identies linkage based on nonlinearity detection by de ning an epistasis measure for each pair of loci to realize linkage identi cation with the epistasis measure.
Journal
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- 情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM）
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情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM） 43 (SIG10(TOM7)), 6-13, 2002-11-15
東京 : 情報処理学会
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Details 詳細情報について
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- CRID
- 1050001337891786112
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- NII Article ID
- 110002711512
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- NII Book ID
- AA11464803
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- ISSN
- 18827780
- 03875806
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- NDL BIB ID
- 6362044
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- Text Lang
- ja
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- Article Type
- article
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- Data Source
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- IRDB
- NDL
- CiNii Articles
