日本在来 Hemerocallis spp. の RAPD 分析による遺伝的変異および類縁関係の評価

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  • RAPD Analysis to Evaluate the Genetic Variation and Relationships in Japanese Hemerocallis spp.
  • ニホン ザイライ Hemerocallis spp. ノ RAPD ブンセキ ニ ヨル イデンテキ ヘンイ オヨビ ルイエン カンケイ ノ ヒョウカ

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説明

RAPD法により,日本国内に自生の Hemerocallis 属内における種,変種および個体間の遺伝的変異を評価し,類縁関係を推定した。20 種のランダムプライマーを用いた PCR で,248 のバンドが検出され,そのうちの 240(96.7%)のバンドで多型がみられた。多型データに基づく AMOVA の結果,遺伝的変異は種間に比べて変種間で小さく,同データによる主座標分析および平均距離法によるクラスター解析により,各変種について既知の分類を反映した配置が得られた。さらに,これらの分析によって,H. dumortieri var. esculenta 内における低地タイプの個体群が遺伝的に区別可能であると共に,H. aurantiaca(ハマカンゾウ)および H. fulva(ノカンゾウ,ヤブカンゾウ)の両種が遺伝的に近縁であることが示唆された。本研究は,DNA マーカーを用いて日本在来の Hemerocallis 属内における遺伝変異および類縁関係を示した最初の報告である。

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was employed to estimate the genetic variation and relationship among species, varieties and individuals within varieties in Hemerocallis native to Japan. Twenty RAPD primers scored 248 bands, and almost all bands (96.7%) were polymorphic. Based on the polymorphic data, AMOVA showed the inter-variety variation was smaller than the inter-species variation, and a distribution reflecting the known classification about each variety by principal coordinates (PCO) and unweighted pair-group method arithmetic average (UPGMA) analysis were obtained. In addition, these analyses were able to genetically differentiate a lowland-type population within H. dumortieri var. esculenta. Furthermore, H. aurantiaca (Hama-kanzou) and H. fulva (No-kanzou and Yabu-kanzou) formed one cluster, suggesting that both species are genetically closely related. Our results indicate, for the first time, the genetic variation and relationships within Japanese Hemerocallis following the application of a DNA marker.

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KJ00008376280

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