ノリプロトプラスト化能を有する海洋細菌Pseudomonas sp.ND137株由来のポルフィラナーゼ遺伝子のクローニング
書誌事項
- タイトル別名
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- ノリプロトプラストカノウ オ ユウスル カイヨウ サイキン Pseudomonas sp ND137カブ ユライ ノ ポルフィラナーゼ イデンシ ノ クローニング
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説明
ノリプロトプラスト化能を有する海洋細菌Pseudomonas sp.ND137株由来のポルフィラナーゼ遺伝子のクローニングを行った。その結果、ポルフィラナーゼA(AAGA)をコードする遺伝子aagAのORFは1,326bpからなることが明らかとなり、コードするアミノ酸残基は441、その推定分子量は48,554であり、GC含量は54.0%であった。また、推定アミノ酸残基のシグナルペプチド、ホモロジーおよびモチーフ検索を行った結果、AAGAはN末端側よりシグナルペプチドを有し、それに続き糖質加水分解酵素ファミリー16に属する触媒領域、C末端領域には糖質結合領域ファミリー13(CBM13)に属する領域、さらに2つの領域間にリンカー配列が存在することが示唆された。AAGAの有するCBM13はStreptomyces lividansキシラーゼ10AおよびリシントキシンBチェーン由来のCBM13と同様の配列を有していたため、AAGAはβ-1、4-キシランおよびガラクトースに結合することが示唆された。
収録刊行物
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- 海と台地 : 佐賀大学海浜台地生物生産研究センター報告書 : Marine & Highland Bioscience Center report
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海と台地 : 佐賀大学海浜台地生物生産研究センター報告書 : Marine & Highland Bioscience Center report 14 33-41, 2002-03
唐津 : 佐賀大学海浜台地生物生産研究センター
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詳細情報 詳細情報について
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- CRID
- 1050282813645043456
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- NII論文ID
- 110000571765
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- NII書誌ID
- AN1050372X
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- ISSN
- 13415344
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- NDL書誌ID
- 6205192
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- 本文言語コード
- ja
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- 資料種別
- journal article
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- データソース種別
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- IRDB
- NDL
- CiNii Articles