Identifying the main forage algal species of horned turbans Turbo sazae from the Izu islands using DNA barcoding

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  • DNAバーコーディングを用いた伊豆諸島におけるサザエ消化管内容物中の微細海藻片の同定
  • DNA バーコーディング オ モチイタ イズ ショトウ ニ オケル サザエ ショウカカン ナイヨウブツ チュウ ノ ビサイ カイソウヘン ノ ドウテイ

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伊豆諸島の4島において海藻植生調査およびサザエの消化管内容物調査を行い，各島のサザエ消化管内容物において最も優占した海藻種4種についてmtDNAのCOX1領域を用いてDNAバーコーディングによる種同定を試みた。消化管内容物のうちNCBIのGenBankに登録のあった1種は相同性100%となり遺伝子の相同性解析のみで種まで同定できた。その一方でGenBankに登録の無かった3種類の海藻については遺伝子の相同性解析のみでは種の同定まではできなかった。しかし，消化管内容物の相同性解析による同定結果と周囲で優占した海藻種は，科の段階まで一致しており，科の推定であればCOX1領域を用いたNCBIのmegablast検索により行うことが可能と考えられた。

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