ベゴモウイルスに1本鎖DNAサテライトが付随することは比較的最近の発見であるが,これらの複合体は単一ゲノムタイプのベゴモウイルス(ジェミニウイルス科)とベータサテライトと呼ばれる小さい環状サテライトからなり,サテライトはヘルパーウイルスの病徴に関与する。アジアではこの複合体に,さらに3番目のDNA 1として知られるサテライト様粒子が常に付随していることが示されており,パキスタンとインド西部に広まっているcotton leaf curl disease(CLCuD)の病原も,このような複合体からなっているとされてきた。しかし,本研究においてPCR法による増殖,ローリングサークル法による増殖およびサザンブロットハイブリダイゼーションにより,近年採集した試料ではDNA 1は必ずしもCLCuDの病原複合体に付随しないことを認めた。すなわち,2005/2006採集および2009/2010採集のCLCuD罹病ワタ66試料からは2005/2006採集の2試料のみがDNA 1を付随しており,その全塩基配列を解析し,DNA 1が付随しないCLCuD病原の発見について議論した。

The association of begomoviruses with single stranded DNA satellites is a relatively recent discovery. Typically the complex consists of a monopartite begomovirus (family Geminiviridae) and a small circular satellite, known as a betasatellite that modulates the symptoms induced by the helper virus. Invariably, at least for this complex in Asia, a third molecule, the satellite-like component known as DNA 1, was shown to be present previously in every field. This was certainly the case for the begomovirus betasatellite complex causing cotton leaf curl disease (CLCuD) across Pakistan and western India. By PCR mediated amplification, rolling circle amplification and Southern blot hybridization, we showed that for more recently collected samples, DNA 1 is no longer a constant companion of the CLCuD complex. Sequence analysis of two full-length DNA 1 molecules from 66 infected cotton samples collected in 2005/2006 and 2009/2010 indicated that the few satellite-like components present are typical of the earlier examples. The significance of these findings in relation to recent changes in the CLCuD complex is discussed.

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論文

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