Genetic Diversity and Population Structure in Native Chicken Populations from Myanmar, Thailand and Laos by Using 102 Indels Markers

La diversité génétique des populations de poulets indigènes du Myanmar, de Thaïlande et du Laos a été examinée à l'aide de 102 marqueurs d'insertion et/ou de délétion (indels). La plupart des loci indels étaient polymorphes (71% à 96%), et la variabilité génétique était similaire dans toutes les populations. Les hétérozygosités moyennes observées (H O ) et les hétérozygosités attendues (H E ) variaient de 0,205 à 0,263 et de 0,239 à 0,381, respectivement. Les coefficients de différenciation génétique (Gst) pour toutes les populations cumulées étaient de 0,125, et les poulets indigènes thaïlandais présentaient un Gst plus élevé (0,088) que les populations du Myanmar (0,041) et du Laos (0,024). Les distances Fst par paire variaient de 0,144 à 0,308 parmi les populations. Un arbre voisin (NJ), utilisant la distance génétique de Nei, a révélé que les populations de poulets indigènes thaïlandais et laotiens étaient génétiquement proches, tandis que les poulets indigènes du Myanmar étaient éloignés des autres. On pensait que les poulets indigènes de ces trois pays descendaient de trois origines différentes (K = 3) d'après l'analyse de LA STRUCTURE. Un mélange génétique a été observé chez les poulets natifs thaïlandais et laotiens, tandis qu'un mélange était absent chez les poulets natifs du Myanmar.

La diversidad genética de las poblaciones de pollos nativos de Myanmar, Tailandia y Laos se examinó mediante el uso de 102 marcadores de inserción y/o eliminación (indels). La mayoría de los loci indels eran polimórficos (71% a 96%), y la variabilidad genética fue similar en todas las poblaciones. La media de heterocigosis observada (H O ) y heterocigosis esperada (H E ) varió de 0,205 a 0,263 y de 0,239 a 0,381, respectivamente. Los coeficientes de diferenciación genética (Gst) para todas las poblaciones acumuladas fueron de 0,125, y los pollos nativos tailandeses mostraron mayor Gst (0,088) que las poblaciones de Myanmar (0,041) y Laos (0,024). Las distancias Fst por pares oscilaron entre 0,144 y 0,308 entre las poblaciones. Un árbol vecino (NJ), utilizando la distancia genética de Nei, reveló que las poblaciones de pollos nativos de Tailandia y Laos eran genéticamente cercanas, mientras que los pollos nativos de Myanmar estaban distantes de los demás. Se pensó que los pollos nativos de estos tres países descendían de tres orígenes diferentes (K = 3) del análisis de LA ESTRUCTURA. La mezcla genética se observó en pollos nativos de Tailandia y Laos, mientras que la mezcla no se observó en pollos nativos de Myanmar.

The genetic diversity of native chicken populations from Myanmar, Thailand, and Laos was examined by using 102 insertion and/or deletion (indels) markers. Most of the indels loci were polymorphic (71% to 96%), and the genetic variability was similar in all populations. The average observed heterozygosities (H O ) and expected heterozygosities (H E ) ranged from 0.205 to 0.263 and 0.239 to 0.381, respectively. The coefficients of genetic differentiation (Gst) for all cumulated populations was 0.125, and the Thai native chickens showed higher Gst (0.088) than Myanmar (0.041) and Laotian (0.024) populations. The pairwise Fst distances ranged from 0.144 to 0.308 among populations. A neighbor-joining (NJ) tree, using Nei's genetic distance, revealed that Thai and Laotian native chicken populations were genetically close, while Myanmar native chickens were distant from the others. The native chickens from these three countries were thought to be descended from three different origins (K = 3) from STRUCTURE analysis. Genetic admixture was observed in Thai and Laotian native chickens, while admixture was absent in Myanmar native chickens.

تم فحص التنوع الجيني لسكان الدجاج الأصليين من ميانمار وتايلاند ولاوس باستخدام 102 من علامات الإدراج و/أو الحذف (indels). كانت معظم مواقع الإندلس متعددة الأشكال (71 ٪ إلى 96 ٪)، وكان التباين الجيني متشابهًا في جميع السكان. تراوح متوسط الزيجوت المتغايرة الملحوظة (HO ) والزيجوت المتغايرة المتوقعة (HE) من 0.205 إلى 0.263 و 0.239 إلى 0.381 على التوالي. بلغت معاملات التمايز الجيني (Gst) لجميع التجمعات السكانية المتراكمة 0.125، وأظهر الدجاج التايلاندي الأصلي تمايزًا جينيًا (0.088) أعلى من سكان ميانمار (0.041) ولاوس (0.024). تراوحت المسافات الأولى الزوجية من 0.144 إلى 0.308 بين السكان. كشفت شجرة مجاورة (NJ)، باستخدام المسافة الوراثية لـ NEI، أن مجموعات الدجاج التايلاندية واللاوسية الأصلية كانت قريبة وراثيًا، في حين أن الدجاج الأصلي في ميانمار كان بعيدًا عن الآخرين. كان يُعتقد أن الدجاج الأصلي من هذه البلدان الثلاثة ينحدر من ثلاثة أصول مختلفة (K = 3) من تحليل البنية. لوحظ المزيج الوراثي في الدجاج الأصلي التايلاندي واللاوسي، في حين كان المزيج غائبًا في الدجاج الأصلي في ميانمار.