Identification of Mycobacterial Species by PCR Sequencing of Quinolone Resistance-Determining Regions of DNA Gyrase Genes

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  • Jean-Noël Dauendorffer
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Isabelle Guillemin
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Alexandra Aubry
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Chantal Truffot-Pernot
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Wladimir Sougakoff
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Vincent Jarlier
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
  • Emmanuelle Cambau
    Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Faculté de Médecine Pitié-Salpêtrière, Université Paris VI, and Centre National de Référence pour la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France

Abstract

<jats:title>ABSTRACT</jats:title> <jats:p> The determination of the amino acid sequence of quinolone resistance-determining regions (QRDRs) in the A and B subunits of DNA gyrase is the molecular test for the detection of fluoroquinolone resistance in mycobacteria. We looked to see if the assignment of mycobacterial species could be obtained simultaneously by analysis of the corresponding nucleotide sequences. PCR sequencing of <jats:italic>gyrA</jats:italic> and <jats:italic>gyrB</jats:italic> QRDRs was performed for 133 reference and clinical strains of 21 mycobacterial species commonly isolated in clinical laboratories. Nucleotide sequences of <jats:italic>gyrA</jats:italic> and <jats:italic>gyrB</jats:italic> QRDRs were species specific, regardless of fluoroquinolone susceptibility. </jats:p>

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