A Study of Hypermethylated Circulating Tumor DNA as a Universal Colorectal Cancer Biomarker
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- Sonia Garrigou
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Geraldine Perkins
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Fanny Garlan
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Corinne Normand
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Audrey Didelot
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Delphine Le Corre
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Sanam Peyvandi
- Department of Gastroenterology, Henri-Mondor Hospital-APHP and EA 7375-EC2M3 Laboratory, University of Paris Est Creteil Val de Marne, Creteil, France
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- Claire Mulot
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Ralph Niarra
- CIC-EC4 URC HEGP, AP-HP, Hôpitaux Universitaires Paris Ouest, Paris, France
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- Pascaline Aucouturier
- CIC-EC4 URC HEGP, AP-HP, Hôpitaux Universitaires Paris Ouest, Paris, France
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- Gilles Chatellier
- CIC-EC4 URC HEGP, AP-HP, Hôpitaux Universitaires Paris Ouest, Paris, France
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- Philippe Nizard
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Karla Perez-Toralla
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Eleonora Zonta
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Cecile Charpy
- Department of Gastroenterology, Henri-Mondor Hospital-APHP and EA 7375-EC2M3 Laboratory, University of Paris Est Creteil Val de Marne, Creteil, France
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- Anais Pujals
- INSERM U955, University of Paris Est Creteil Val de Marne and Department of Pathology, AP-HP, Henri-Mondor Hospital, Créteil, France
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- Caroline Barau
- CRB, AP-HP, Henri-Mondor Hospital, Créteil, France
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- Olivier Bouché
- Service d'hépatogastroentérologie et de cancérologie digestive, CHU de Reims, Hôpital Robert-Debré, Reims Cedex, France
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- Jean-François Emile
- Department of Pathology, Hôpital Ambroise Paré, AP-HP, Université de Versailles St Quentin en Yvelines, Boulogne-Billancourt, France
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- Denis Pezet
- CHU Clermont Ferrand, Clermont Ferrand Cedex 1, France
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- Frederic Bibeau
- Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier, France
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- J Brian Hutchison
- RainDance Technologies, Billerica, MA
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- Darren R Link
- RainDance Technologies, Billerica, MA
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- Aziz Zaanan
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Pierre Laurent-Puig
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
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- Iradj Sobhani
- Department of Gastroenterology, Henri-Mondor Hospital-APHP and EA 7375-EC2M3 Laboratory, University of Paris Est Creteil Val de Marne, Creteil, France
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- Valerie Taly
- Université Paris Sorbonne Cité, INSERM UMR-S1147, CNRS SNC5014, Centre Universitaire des Saints-Pères, Paris Cedex 06, France. Equipe labélisée Ligue contre le cancer
説明
<jats:title>Abstract</jats:title><jats:sec><jats:title>BACKGROUND</jats:title><jats:p>Circulating tumor DNA (ctDNA) has emerged as a good candidate for tracking tumor dynamics in different cancer types, potentially avoiding repeated tumor biopsies. Many different genes can be mutated within a tumor, complicating procedures for tumor monitoring, even with highly sensitive next-generation sequencing (NGS) strategies. Droplet-based digital PCR (dPCR) is a highly sensitive and quantitative procedure, allowing detection of very low amounts of circulating tumor genetic material, but can be limited in the total number of target loci monitored.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>METHODS</jats:title><jats:p>We analyzed hypermethylation of 3 genes, by use of droplet-based dPCR in different stages of colorectal cancer (CRC), to identify universal markers for tumor follow-up.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>RESULTS</jats:title><jats:p>Hypermethylation of WIF1 (WNT inhibitory factor 1) and NPY (neuropeptide Y) genes was significantly higher in tumor tissue compared to normal tissue, independently of tumor stage. All tumor tissues appeared positive for one of the 2 markers. Methylated ctDNA (MetctDNA) was detected in 80% of metastatic CRC and 45% of localized CRC. For samples with detectable mutations in ctDNA, MetctDNA and mutant ctDNA (MutctDNA) fractions were correlated. During follow-up of different stage CRC patients, MetctDNA changes allowed monitoring of tumor evolution.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>CONCLUSIONS</jats:title><jats:p>These results indicate that MetctDNA could be used as a universal surrogate marker for tumor follow-up in CRC patients, and monitoring MetctDNA by droplet-based dPCR could avoid the need for monitoring mutations.</jats:p></jats:sec>
収録刊行物
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- Clinical Chemistry
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Clinical Chemistry 62 (8), 1129-1139, 2016-08-01
Oxford University Press (OUP)