-
- Jordi Garcia-Mas
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Andrej Benjak
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Walter Sanseverino
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Michael Bourgeois
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Gisela Mir
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Víctor M. González
- Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Elizabeth Hénaff
- Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Francisco Câmara
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Luca Cozzuto
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Ernesto Lowy
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Tyler Alioto
- Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica, 08028 Barcelona, Spain;
-
- Salvador Capella-Gutiérrez
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Jose Blanca
- Institute for the Conservation and Breeding of Agricultural Biodiversity, Universitat Politècnica de Valencia, 46022 Valencia, Spain;
-
- Joaquín Cañizares
- Institute for the Conservation and Breeding of Agricultural Biodiversity, Universitat Politècnica de Valencia, 46022 Valencia, Spain;
-
- Pello Ziarsolo
- Institute for the Conservation and Breeding of Agricultural Biodiversity, Universitat Politècnica de Valencia, 46022 Valencia, Spain;
-
- Daniel Gonzalez-Ibeas
- Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal, Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 30100 Murcia, Spain;
-
- Luis Rodríguez-Moreno
- Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal, Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 30100 Murcia, Spain;
-
- Marcus Droege
- Roche Diagnostics Deutschland GmbH, 11668305 Mannheim, Germany;
-
- Lei Du
- Roche Diagnostics Asia Pacific Pte. Ltd., Singapore 168730;
-
- Miguel Alvarez-Tejado
- Roche Applied Science, 08174 Barcelona, Spain;
-
- Belen Lorente-Galdos
- Institut de Biologia Evolutiva, Universitat Pompeu Fabra-Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Marta Melé
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Luming Yang
- Horticulture Department, University of Wisconsin, Madison, WI 53706;
-
- Yiqun Weng
- Horticulture Department, University of Wisconsin, Madison, WI 53706;
-
- Arcadi Navarro
- Institut de Biologia Evolutiva, Universitat Pompeu Fabra-Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Tomas Marques-Bonet
- Institut de Biologia Evolutiva, Universitat Pompeu Fabra-Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Miguel A. Aranda
- Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal, Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 30100 Murcia, Spain;
-
- Fernando Nuez
- Institute for the Conservation and Breeding of Agricultural Biodiversity, Universitat Politècnica de Valencia, 46022 Valencia, Spain;
-
- Belén Picó
- Institute for the Conservation and Breeding of Agricultural Biodiversity, Universitat Politècnica de Valencia, 46022 Valencia, Spain;
-
- Toni Gabaldón
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Guglielmo Roma
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Roderic Guigó
- Centre for Genomic Regulation, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain;
-
- Josep M. Casacuberta
- Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Pere Arús
- Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries, Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
-
- Pere Puigdomènech
- Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Científicas-Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-Universitat Autònoma de Barcelona-Universitat de Barcelona, 08193 Barcelona, Spain;
書誌事項
- タイトル別名
-
- The genome of melon (Cucumis melo L.).
説明
<jats:p>We report the genome sequence of melon, an important horticultural crop worldwide. We assembled 375 Mb of the double-haploid line DHL92, representing 83.3% of the estimated melon genome. We predicted 27,427 protein-coding genes, which we analyzed by reconstructing 22,218 phylogenetic trees, allowing mapping of the orthology and paralogy relationships of sequenced plant genomes. We observed the absence of recent whole-genome duplications in the melon lineage since the ancient eudicot triplication, and our data suggest that transposon amplification may in part explain the increased size of the melon genome compared with the close relative cucumber. A low number of nucleotide-binding site–leucine-rich repeat disease resistance genes were annotated, suggesting the existence of specific defense mechanisms in this species. The DHL92 genome was compared with that of its parental lines allowing the quantification of sequence variability in the species. The use of the genome sequence in future investigations will facilitate the understanding of evolution of cucurbits and the improvement of breeding strategies.</jats:p>
収録刊行物
-
- Proceedings of the National Academy of Sciences
-
Proceedings of the National Academy of Sciences 109 (29), 11872-11877, 2012-07-02
Proceedings of the National Academy of Sciences
