Ｔｗｏ‐ｐａｓｓ　ＴＳＡ‐ＦＩＳＨ法によるメタン生成古細菌のｍｃｒ遺伝子の検出

DOI
  • 川上 周司
    長岡技術科学大学大学院環境システム工学専攻
  • 久保田 健吾
    長岡技術科学大学大学院環境システム工学専攻
  • 井町 寛之
    長岡技術科学大学大学院環境システム工学専攻 海洋研究開発機構極限環境生物研究センター
  • 原田 秀樹
    長岡技術科学大学大学院環境システム工学専攻 東北大学大学院工学研究科土木工学専攻
  • 大橋 晶良
    長岡技術科学大学大学院環境システム工学専攻

書誌事項

タイトル別名
  • Visual detection of chromosomal encoded methyl coenzyme M reductase gene of a methanogen by two-pass tyramide signal amplification-fluorescence in situ hybridization (two-pass TSA-FISH) with polydeoxyribonucleotide probes

説明

Applicability and reliability of two-pass tyramide signal amplification-fluorescence in situ hybridization (two-pass TSA-FISH) with PCR generated polydeoxyribonucleotide probes, specific for chromosomal encoded gene, methyl coenzyme M reductase (mcr) in Methanococcus vannielli, was tested and evaluated. The probes were labeled with dinitrophenol (DNP) and the efficiency of probe-labeling was improved by optimizing the concentrations of DNP-labeled nucleotide and Mg2+ in PCR mixture. The target mcr gene was successfully detected, which was again verified by the disappearance of the signals after treating the target with DNase prior to hybridization or washing with high stringency buffer. However, a few nonspecific signals were observed when the method was applied to pure cultures of Methanoculleus bourgensis and Escherichia coli.

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001204111490176
  • NII論文ID
    130003949508
  • DOI
    10.11532/proes1992.43.143
  • ISSN
    1884829X
    13415115
  • 本文言語コード
    ja
  • 資料種別
    journal article
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
    • KAKEN
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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