キャラクターによる遺伝子配列の系統樹表現

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  • Character Representation of Phylogenetic Trees for Biomolecular Sequences

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説明

ゲノム情報解析のための計算機技術のひとつとして、本論文では、DNA配列やタンパク質配列が与えられたときに、それらの系統樹をグラフィックではなく、+、-、| などのキャラクターを用いて近似的に表現するための方法について述べる。枝の長さが類似度あるいは距離の尺度に正確に対応はしていないが、木の構造やノード間の相対的位置などほとんどの系統樹情報が再現されている。キャラクターを用いていることから、同一の表示プログラムを種々のハード、OSの上で利用できる利点がある。系統樹をマルチプルアラインメント結果と並列に表示して、木構造と配列パターンとを同時に比較したり、アラインメントアルゴリズムの解析や開発が容易に行なえる。さらに、この系統樹情報を配列データと同様に電子メールでそのまま転送することもでき、分子生物学や情報科学の研究者間の円滑な情報交換に役立つ。

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001204490411520
  • NII論文ID
    130003997502
  • DOI
    10.11234/gi1990.2.82
  • ISSN
    2185842X
    09199454
  • 本文言語コード
    en
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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