ショットガンシーケンス

DOI
  • YAMASHITA Tomoya
    神戸大学大学院医学研究科内科学講座循環器内科学分野
  • HIRATA Ken-ichi
    神戸大学大学院医学研究科内科学講座循環器内科学分野

Description

腸内細菌メタゲノム解析では，細菌の全ゲノム情報を解析し，どのような菌がどれくらい存在するかという情報以外に，どのような遺伝子をどれくらい持つかなども知ることができる．糞便などから抽出した全ゲノムDNAを，制限酵素などで物理的に切断し，切断された短いDNA鎖を，次世代シーケンサーを用いて無作為に配列の決定をする．そのDNA断片の配列の重なり部分をコンピュータ上でつなぎ合わせることで，連続した全ゲノムの遺伝子配列を決定するという方法である．ヒトゲノム計画でも，この方法を用いて解析された．コンピュータの計算処理能力の進歩とデータ処理方法の開発により，遺伝子配列が比較的容易に決定できるようになった．

Journal

  • Farumashia

    Farumashia 53 (11), 1101_2-1101_2, 2017

    The Pharmaceutical Society of Japan

Details 詳細情報について

  • CRID
    1390001204502148736
  • NII Article ID
    130006191782
  • DOI
    10.14894/faruawpsj.53.11_1101_2
  • ISSN
    21897026
    00148601
  • Text Lang
    ja
  • Data Source
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • Abstract License Flag
    Disallowed

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