アカシア・マンギウムにおける分化中木部およびシュートのEST解析

DOI

書誌事項

タイトル別名
  • EST analysis of developing xylem and shoot in <I>Acacia mangium</I>

抄録

アカシア・マンギウムは、高い成長性を示す熱帯性早生樹で、東南アジア各地で紙・パルプ用材として広く植林されている。精英樹選抜は行われているものの、遺伝子情報をもとにした分子育種は全く進んでいない。本研究では、分子育種を行うための基盤整備として、アカシア・マンギウムの分化中木部およびシュートにおけるEST解析を行ったので報告する。<br> アカシア・マンギウムの分化中木部およびシュートより、トータルRNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを得たのち、ノーマライゼーション処理を行った。その後、得られたノーマライズドcDNAをベクターにつなぎ、大腸菌に導入してcDNAライブラリーを調製した。得られたcDNAライブラリーから、ランダムに10,752の独立したクローンを選び、PCR反応によりインサートを増幅した。増幅されたインサート配列は、サンガー法によってシーケンシングした。得られた配列をBLASTX解析に供したところ、7,710個の配列については、SwissProtにおいて相同配列が見出され、そのうちの60%が完全長クローンであった。現在、これらの配列のアノテーション作業を進めている。

収録刊行物

詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001205632175744
  • NII論文ID
    130006993729
  • DOI
    10.14841/jspp.2009.0.1007.0
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

問題の指摘

ページトップへ