van Krevelen diagram を用いたメタボローム解析による遺伝子機能の探索
書誌事項
- タイトル別名
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- Gene Function Analysis Using FT-ICR/MS Metabolomics with the van Krevelen Diagram
抄録
我々はこれまでに FT-ICR/MS (フーリエ変換イオンサイクロトロン型質量分離装置) を用いたメタボロミクスプラットフォームを整備してきた．FT-ICR/MS は超高分解能を有し，得られる精密質量値から元素組成式を推測することが可能である．これらの特性を活かしメタボロミクスプラットフォームをさらに発展させるため，元素組成式中の元素数比をプロットする van Krevelen diagram を用いた新規のメタボローム解析手法の確立を目指している．本発表では，化合物の元素組成変化に着目した新規解析手法がメタボロミクス研究において酵素反応による代謝物変動を解析する上で有効であり，遺伝子の機能解明にも応用可能であることを示す．<br> van Krevelen diagram を用いたメタボローム解析により機能未知アシルトランスフェラーゼおよびシトクロム P450 遺伝子の機能解明を試みた．これらの遺伝子のノックアウト植物を用いて FT-ICR/MS による代謝物分析を行い，得られた精密質量から元素組成式を推測した．メタボロミクスデータを van Krevelen diagram 上で解析し，これらの遺伝子が関与する代謝活性および代謝経路を予想した．さらに組み換えタンパク質を作製し，新規メタボロミクス解析手法から導かれた仮説を酵素反応解析により実証した．
収録刊行物
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- 日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集
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日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集 2009 (0), 0314-0314, 2009
日本植物生理学会
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詳細情報 詳細情報について
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- CRID
- 1390001205632563712
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- NII論文ID
- 130006994319
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- データソース種別
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- JaLC
- CiNii Articles
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- 抄録ライセンスフラグ
- 使用不可