トマトのトランスクリプトーム・データベース: TOMATOMICS

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タイトル別名
  • Tomato Transcriptome Database: TOMATOMICS

抄録

当プロジェクトでは, トマト（Solanum lycopersicum）の矮性品種マイクロトムに由来するcDNAリソース解析とデータベース整備を進めている. これまでに得られたトランスクリプトームの解析結果は, データベースMiBASE（http://www.pgb.kazusa.or.jp/mibase/）とKaFTom（http://www.pgb.kazusa.or.jp/kaftom/）から提供している. MiBASEからは, マイクロトムcDNAを含むトマトESTから構築したUnigene（KTU; Kazusa Tomato Unigene）の配列および機能アノテーションなどの情報を提供している. KaFTomには, マイクロトム完全長cDNAから解読した約1.3万個のHTC（High Throughput cDNA）のアノテーションを格納している. <br>現在, マニュアルキュレーションより精査したゲノムの構造アノテーションやKTUの更新（KTU version 4）などを進めており, MiBASEとKaFTomの情報を格納した統合データベースTOMATOMICSを構築している.<br>[謝辞] 本研究は, ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）のサポートを受けるとともに, 佐藤忍先生（筑波大学）および有江力先生（東京農工大）の協力のもと, 実施しています.

収録刊行物

詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001205636027136
  • NII論文ID
    130006998626
  • DOI
    10.14841/jspp.2011.0.0827.0
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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