走査型プローブ顕微鏡応用によるゲノム解析技術の開発

  • 杉山 滋
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
  • 塚本 和己
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
  • 山内 武志
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
  • 吉野 智之
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
  • 高橋 宏和
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
  • 桑崎 誠剛
    独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
  • 末次 克行
    独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
  • 生川 潤子
    独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
  • 山本 公子
    独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
  • 大谷 敏郎
    独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット

書誌事項

タイトル別名
  • Development of a Novel Genome Analysis Method Based on Scanning Probe Microscopy
  • ソウサガタ プローブ ケンビキョウ オウヨウ ニ ヨル ゲノム カイセキ ギジュツ ノ カイハツ

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抄録

Recently, in the field of genome sequencing, next generation DNA sequencers are becoming available, and even the genome sequence analysis of a higher animal and/or a plant can be finished within a short period. However, the next generation DNA sequencers can only read relatively short sequence, which causes difficulty in the assemble step (i.e. reconstruction of original genomic sequence) and makes it labor and time consuming process and results in the long time requiring for gene isolation and breeding. When a target organism does not have enough genomic information, the assemble becomes much harder or not possible. This difficulty is arisen from the absence of positional index of the obtained nucleotide sequences by a whole genome shot-gun method. Therefore, we started the development of a new, scanning probe microscope based genome analysis method that can acquire the nucleotide sequences with positional indexes on the genome.

収録刊行物

  • 表面科学

    表面科学 30 (8), 427-432, 2009

    公益社団法人 日本表面科学会

参考文献 (30)*注記

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