ハイブリッドQM/MM分子シミュレーションによる生体内化学反応と機能の研究

  • 林 重彦
    京都大学大学院理学研究科化学専攻 / 科学技術振興機構さきがけ

書誌事項

タイトル別名
  • Chemical Reactions in Biological Systems Studied by Hybrid QM/MM Simulations
  • ハイブリッド QM MM ブンシ シミュレーション ニ ヨル セイタイナイ カガク ハンノウ ト キノウ ノ ケンキュウ

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説明

Chemical reactions play important roles in biological functions. In order to elucidate molecular mechanism of the chemical reactions in biosystems, so-called hybrid quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) methods have been developed and applied to many biochemical reactions recently. The methods permit one to calculate electronic states of reaction substrate molecules in protein binding pockets by taking into account molecular interactions with the surrounding protein environment. In this review, we survey our QM/MM studies for chemical reactions in rhodopsin photoreceptor proteins and F1-ATP synthase along with a brief introduction of the methodology.<br>

収録刊行物

  • 生物物理

    生物物理 46 (2), 76-81, 2006

    一般社団法人 日本生物物理学会

参考文献 (24)*注記

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