房総半島においてスギと共生するアーバスキュラー菌根菌の多様性

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タイトル別名
  • Diversity of arbuscular mycorrhizal fungi associated with <i>Cryptomeria japonica</i> in Boso Peninsula

抄録

<p>スギの根にはアーバスキュラー菌根（AM）菌が共生しているが、共生する菌種は明らかにされていない。本研究ではスギに共生するAM菌種を明らかにするために、東京大学附属千葉演習林85年生スギ人工林において、AM菌の種構成を調査した。2016年7月に3品種18個体のスギから、各個体5本の細根を採取してDNAを抽出し、AM菌の18S rDNA領域と 28S rDNA領域の一部、5.8S rDNAとITSの全領域を含む領域をPCR増幅した。増幅断片をサブクローニングした後、各個体11～12、合計213クローンの塩基配列を決定した。決定した配列を95%の配列相同性を閾値としたクラスタリングにより操作的分類単位（OTU）に分類した後、各OTUの代表配列に既知のAM菌全21属の代表配列を加えて近隣結合法による系統樹を作成した。その結果、70のOTUが同定されそのうち6OTUが既知の5属と推定された。残りの64OTUは既知の属とクレードを形成せず、所属する属を推定できなかった。以上の結果から、スギと共生するAM菌種は多様であり、既知種とは系統的に大きく異なる菌種も共生している可能性が示唆された。</p>

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001288033693184
  • NII論文ID
    130007376276
  • DOI
    10.11519/jfsc.129.0_686
  • 本文言語コード
    ja
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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