タンパク質内エネルギー移動ネットワーク

  • 倭 剛久
    名古屋大学大学院理学研究科物質理学専攻

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タイトル別名
  • Energy Transport Network in Proteins
  • タンパクシツ ナイ エネルギー イドウ ネットワーク

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抄録

<p>Within a thermally fluctuating protein molecule under physiological conditions, tightly packed amino acid residues interact with each other through energy and heat exchanges. We have developed a computer program CURP (CURrent calculation for Proteins), which is suitable for analyzing non-uniform flow of heat and energy in proteins. We illustrate and characterize non-uniform pattern of energy flow in proteins with the energy exchange network (EEN) model based on the transport coefficient of energy flow between each residue pair. EEN diagrams demonstrated characteristic features of “hidden dynamic allostery” in PDZ domain and allosteric transition in the oxygen sensor domain of FixL.</p>

収録刊行物

  • 生物物理

    生物物理 60 (2), 094-097, 2020

    一般社団法人 日本生物物理学会

参考文献 (17)*注記

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