PubChem のデータを用いた分子座標の作成‐データベースを用いてGaussian16 の入力ファイルを作成する方法‐

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  • PubChem ノ データ オ モチイタ ブンシ ザヒョウ ノ サクセイ データベース オ モチイテ Gaussian16 ノ ニュウリョク ファイル オ サクセイ スル ホウホウ

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NIH のデータベースであるPubChem に収録されているデータを使用して，汎用分子軌道プログラムであるGaussian 16 の入力ファイルを作成する方法について述べている。座標データである.sdf ファイルをPubChem からダウンロードして，Openbabel を使用して入力ファイルに変換を行う。Openbabel を使用することで他のプログラムの入力を作成することも容易となる。

研究ノート / Research Notes

source:Josai Information Sciences Researches

identifier:JOS-InfoBull-2903

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