AtCAST: An Advanced Transcriptome Analysis Tool for <i>Arabidopsis thaliana</i>

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Other Title
  • AtCAST
  • シロイヌナズナの発展型トランスクリプトームデータ解析ツール

Description

本稿では進歩し続けているトランスクリプトーム解析を取り巻く現状と，関連する解析ツールについて紹介する．なかでも，モデル植物のシロイヌナズナのトランスクリプトーム解析用にわれわれが最近開発しウェブ上で提供しているAtCAST（http://atpbsmd.yokohama-cu.ac.jp/）について詳しく解説する．近年ではトランスクリプトームデータ同士や各種オミクスデータなどを合わせてさらに解析するなど，発展型トランスクリプトーム解析ツールの開発が盛んである．AtCASTはこのような発展型トランスクリプトーム解析ツールの一つであり，基本的な統計解析に引き続いてGOE解析やMCN解析といったトランスクリプトームデータの解釈を助ける解析をまとめて行うツールである．

Journal

  • KAGAKU TO SEIBUTSU

    KAGAKU TO SEIBUTSU 54 (6), 408-415, 2016

    Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry

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