プロトンの水和自由エネルギー: 酸解離定数および標準水素電極電位の高精度計算

DOI Web Site 被引用文献2件 参考文献33件
  • 松井 亨
    筑波大学大学院数理物質科学研究科
  • 喜屋武 茜
    筑波大学大学院数理物質科学研究科
  • 庄司 光男
    筑波大学大学院数理物質科学研究科 筑波大学計算科学研究センター
  • 重田 育照
    筑波大学大学院数理物質科学研究科 筑波大学計算科学研究センター

書誌事項

タイトル別名
  • Solvation Energy of Proton: a Consistent Calculation Schemefor Acid Dissociation Constantsand Standard Hydrogen Electrode Potentials

説明

<p>本総説では，分極誘電体モデルと量子化学計算に基づく酸解離定数(pKa)の計算手法について述べる．この手法では，参照分子に対して計算により得られる自由エネルギー差と実験により得られるpKa値から官能基毎の線形関係を導くことで，アミノ酸の側鎖のpKaの半定量的な計算が可能になる．ペプチド3量体の計算においては，周囲のアミノ酸の水素結合の効果によってpKaが単量体とくらべ大きく(3 pKa単位)異なることがわかる．また本手法は標準水素電極電位の計算にも適用可能であり，いくつかの酸化還元反応の誤差はCCSD (T)/aug-cc-pVDZでは0.1V以内であり，B3LYPでも同程度の精度で酸化還元電位が計算される．</p>

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