RNA-Sequence Analysis by Next-Generation Sequencer for the Early Diagnosis of Respiratory Disease

DOI Web Site 4 References
  • FUKANO Yoshihito
    日本大学工学部 生命応用化学科，〒963-8642 福島県郡山市田村町徳定字中河原1
  • MIYAZAWA Yuki
    日本大学工学部 生命応用化学科，〒963-8642 福島県郡山市田村町徳定字中河原1
  • MIKOSHI Taiju
    日本大学工学部 情報工学科，〒963-8642 福島県郡山市田村町徳定字中河原1
  • INOUE Toshio
    日本大学医学部 内科学系呼吸器内科学分野，〒173-8641 東京都板橋区大谷口上町30-1
  • MARUOKA Shuuichirou
    日本大学医学部 内科学系呼吸器内科学分野，〒173-8641 東京都板橋区大谷口上町30-1
  • KURODA Kazumichi
    日本大学医学部 病態病理学系微生物学分野，〒173-8641 東京都板橋区大谷口上町30-1
  • GON Yasuhiro
    日本大学医学部 内科学系呼吸器内科学分野，〒173-8641 東京都板橋区大谷口上町30-1
  • HASHIMOTO Shu
    日本大学医学部 内科学系呼吸器内科学分野，〒173-8641 東京都板橋区大谷口上町30-1
  • YAMAGISHI Kenji
    日本大学工学部 生命応用化学科，〒963-8642 福島県郡山市田村町徳定字中河原1

Bibliographic Information

Other Title
  • 次世代シーケンサーを用いたRNA-seq解析手法の確立と 呼吸器疾患症早期診断システムへの展開

Abstract

To establish a system for the early diagnosis of respiratory diseases, we developed a method for analyzing RNA sequence data obtained by next-generation sequencer identify genes showing altered expression as biomarkers of respiratory tract infection. The respiratory tracts of mice were exposed to lipopolysaccharide to establish a model of respiratory disease. Twenty-five genes exhibited significantly altered RNA expression following exposure. We identified non-coding RNAs in five regions that could be candidate biomarkers of respiratory diseases.

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