Gromacsのための計算支援ソフトGISPの開発

DOI Web Site Web Site 参考文献4件
  • 森 一樹
    横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5 横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5
  • 樺島 智大
    伊藤忠テクノソリューションズ株式会社科学システム事業部, 〒100-6080 東京都千代田区霞が関3-2-5 伊藤忠テクノソリューションズ株式会社科学システム事業部, 〒100-6080 東京都千代田区霞が関3-2-5
  • 源 聡
    伊藤忠テクノソリューションズ株式会社科学システム事業部, 〒100-6080 東京都千代田区霞が関3-2-5 伊藤忠テクノソリューションズ株式会社科学システム事業部, 〒100-6080 東京都千代田区霞が関3-2-5
  • 玉城 哲平
    横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5 横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5
  • 上田 一義
    横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5 横浜国立大学大学院工学研究院, 〒240-8501 横浜市保土ヶ谷区常盤台79-5

書誌事項

タイトル別名
  • Development of Gromacs Support Program: GISP
  • Gromacs ノ タメ ノ ケイサン シエン ソフト GISP ノ カイハツ

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抄録

分子動力学計算(MD計算)ソフトGromacsの計算支援ソフトGISP (Gromacs Input-file Supporting Program)を開発した．現在のバージョンでは，計算を行いたい分子のPDBファイルをGISPから選択するだけで，コマンドラインでの入力を行わずにグラフィカルユーザーインターフェイス(GUI)から簡単にMD計算を行うことができる．また計算結果を解析する際は選択項目のボタンを押すだけでプロット及び表示することができる．GISPはpythonによってコーディングされているため，非常に拡張性が高いことが特徴である．今後MD計算を始めてみたい方やMD計算の講義などに有用で，MD計算を広められると考えている．本論文では，GISPの機能紹介と公開について記述している．

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