シロイヌナズナにおけるPIF4/5依存性光形態形成の分子機構：Web検察を用いた新しいアプローチの試み

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タイトル別名
  • Web-query-aided identification a downstream regulator of the phytochrome-interacting-factors (PIF4/5)-mediated signaling pathway in Arabidopsis thaliana

抄録

シロイヌナズナにおいては、光形態形成や光周性花成などの光シグナル応答に関して膨大な基盤が確立されつつある。その中で注目されているのが、phyBと直接相互作用するbHLH型転写因子PIFファミリーである。中でもphyBのみならず概日時計及びジベレリン（GA）の制御下にもあるPIF4/5の働きは重要であり、phyB・時計・GA → PIF4/5 → 光形態制御（忌陰反応を含む）の分子機構が明らかになりつつある。しかし、PIF4/5の下流で働く因子（X）は不明である。今回はXの有力候補（ホメオドメイン型転写因子ATHB2）を同定したので報告する。<br> シロイヌナズナにおいて多くの情報伝達経路が明らかにされている。しかし一般論として、これら情報伝達経路は下流になるほど関連因子が多様に分散する傾向にある。したがって、マイクロアレイなどの解析が試みられているが下流因子の同定に至った例は少ない。そこで今回は新しいアプローチを試みることにした。(1) PIF4/5の下流で機能する因子が満たすべき性質をできるだけ多数設定する。(2) シロイヌナズナ遺伝子群に関して蓄積された膨大な知見をWeb検索して、設定した諸条件を過不足なく満たす候補遺伝子をイン・シリコで推定する。(3) それを実験的に検証する。この新しいアプローチの有効性を示しつつ、PIF4/5依存性光形態形成分子機構に関して考察する。

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390282680606917632
  • NII論文ID
    130006990811
  • DOI
    10.14841/jspp.2010.0.0514.0
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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