FTICR-MSによるタンパク質翻訳後修飾解析
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- 高橋 勝利
- 産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
書誌事項
- タイトル別名
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- Identification of protein post-translational modification using FTICR-MS
説明
細胞内・生体内におけるタンパク質機能はリン酸化、アセチル化、メチル化、グリコシル化などの翻訳後修飾によって高次に制御されている。特にこれらの翻訳後修飾は、細胞内部におけるシグナル伝達・遺伝子発現制御ネットワーク、細胞間情報伝達などにおいて非常に重要や役割を担っており、また、翻訳後修飾の異常は、癌をはじめとした様々な病気に直接・間接的に影響を及ぼすことが知られている。近年のプロテオミクス技術の進歩、特にタンデム質量分析技術の進歩に伴って、細胞・組織中で発現しているタンパク質を同定するだけではなく、同時に翻訳後修飾などに関する情報を得ることが可能になってきた。 質量分析計を用いて、翻訳後修飾の同定を行う場合、基本的に次の二つのステップが必要である。(i)翻訳後修飾を受けたタンパク質またばペプチドをソフトにイオン化し質量を決定する、(ii)翻訳後修飾を受けたタンパク質またはペプチドイオンを気相中で断片化し、構造情報を読み取る。翻訳後修飾は熱的、化学的に不安定であることも多く、それを壊さないように、ソフトにイオン化して、精密な質量電荷比を測定することが必要である。また、翻訳後修飾を受けたタンパク質・ペプチドなどの複合体の構造解析を行うためには、様々な特性の異なる断片化法を組み合わせることも効果的である。フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析計(FTICR-MS)はルーティン的な使用時でも、定常的に一万以上の質量分解能と数ppmでの高精度質量分析を実現できる、優れた質量分析計であり、プロテオミクス分野での利用が広がっている。FTICR-MSはイオントラップ型の質量分析装置であり、超伝導マグネットが作る磁場中においたICRセル内部にイオンをトラップし、その質量電荷比を、非接触的な手法で測定することができる。また、FTICR-MSでは、ICRセル内にトラップしたイオンを、衝突誘起解離(CID)、赤外線多光子吸収解離(IRMPD)、電子捕獲解離(ECD)などの様々な手法で断片化することができるため、糖鎖付加を受けたペプチドやリン酸化を受けたペプチドなど、複雑な複合分子の構造解析に適している。 講演では、特に糖鎖付加を受けたペプチドの構造解析を例に取り、FTICR-MSを用いたタンパク質翻訳後修飾の同定技術についての現状を述べ、今後の生命科学においてどのような位置づけが期待されるのかを議論したい。
収録刊行物
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- 日本プロテオーム学会大会要旨集
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日本プロテオーム学会大会要旨集 2005 (0), 54-54, 2005
日本プロテオーム学会(日本ヒトプロテオーム機構)
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キーワード
詳細情報 詳細情報について
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- CRID
- 1390282680612784640
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- NII論文ID
- 130006998699
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- データソース種別
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- JaLC
- CiNii Articles
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- 抄録ライセンスフラグ
- 使用不可