有機分子立体配座コード化プログラム解析

DOI
  • 和泉 博
    産業技術総合研究所 環境管理研究部門

書誌事項

タイトル別名
  • Structural analysis using the program of conformational code for organic molecules (CCOM)

説明

有機分子の立体構造を表示する多くのソフトウェアではクリック操作で光学活性分子のキラリティーを簡単に表示することが可能である。一方で、ゴーシュプラス、トランスなどの有機分子のコンフォメーションを簡便に表示するソフトウェアは存在していない。クリック操作であらゆる有機分子の立体配座をコード化できるプログラム(CCOM)を作成し、その最適化分子構造ファイルの自動抽出機能によるプラバスタチンナトリウムの赤外円二色性（VCD）立体配座解析を行った。CCOMによる各コンフォマーの出力は、立体配座コードとギブズ自由エネルギー値の情報を含むsdfファイル形式として整理した。さらに、２次元の化学構造式の部分構造検索が可能なSMARTS記法と立体配座コードを結び付けることにより、メバスタチンX線結晶構造データのような異なる分子でも 3Dフラグメント構造検索が出来た。

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キーワード

詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390282680713607552
  • NII論文ID
    130005146328
  • DOI
    10.11545/ciqs.2015.0_22
  • 本文言語コード
    ja
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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