How can we extract reaction coordinates from molecular dynamics simulations of biomolecules?

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  • 生体分子の分子シミュレーションから反応座標をどう抜き出すか?

Abstract

<p>生体分子の機能を調べるためには構造変化のダイナミクス、特にその分子的な詳細を調べなければならない。現在は計算機も高速になり、小さな系であれば構造変化をサンプルすることも可能になりつつあるが、その際にどの反応座標で反応を解析するかということに関してはまだ経験的であり、最適な手法は見つかっていない。ここでは拡散マップ法を用いて、転移温度上のシニョリンのダイナミクスから、どのように反応座標が抜き出されるか調べたい。</p>

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Details 詳細情報について

  • CRID
    1390282681022609280
  • NII Article ID
    130006711202
  • DOI
    10.11316/jpsgaiyo.72.1.0_3237
  • ISSN
    21890803
  • Text Lang
    ja
  • Data Source
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • Abstract License Flag
    Disallowed

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