<i>Ki</i>Bank:創薬のためのタンパク質—化合物相互作用解析支援データベース

  • 愛澤 昌宏
    東京大学生産技術研究所計算科学技術連携研究センター
  • 小野寺 賢司
    東京大学生産技術研究所計算科学技術連携研究センター
  • 張 軍衛
    東京大学生産技術研究所計算科学技術連携研究センター
  • 甘利 真司
    東京大学生産技術研究所計算科学技術連携研究センター
  • 岩澤 義郎
    アドバンスソフト株式会社
  • 中野 達也
    国立医薬品食品衛生研究所安全情報部
  • 中田 琴子
    国立医薬品食品衛生研究所安全情報部

書誌事項

タイトル別名
  • <i>Ki</i>Bank: A Database for Computer-Aided Drug Design Based on Protein-Chemical Interaction Analysis
  • KiBank:創薬のためのタンパク質--化合物相互作用解析支援データベース
  • KiBank ソウヤク ノ タメ ノ タンパクシツ カゴウブツ ソウゴ サヨウ カイセキ シエン データベース

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説明

  KiBank is a database for computer-aided drug design and consists of binding affinities and chemical and target protein structures. Each chemical or protein structure with hydrogen atoms added was optimized by energy minimization and stored in PDB or MDL MOL file format, so that the structural data can be directly used for in silico binding studies. To describe the extent of inhibition, the inhibition constant (Ki) value is used to simplify comparisons of strengths among chemical-protein bindings. As of April 2004, KiBank contained 142 proteins, over 5000 chemicals, and over 6000 binding affinity values that were published in peer-reviewed journals. The binding affinity values are currently mostly for membrane and nuclear receptors but are soon being expanded to other drug targets. KiBank is updated daily and can be accessed on the Web at http://kibank.iis.u-tokyo.ac.jp/at no charge.<br>

収録刊行物

  • 薬学雑誌

    薬学雑誌 124 (9), 613-619, 2004-09-01

    公益社団法人 日本薬学会

被引用文献 (5)*注記

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参考文献 (38)*注記

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