遺伝子座特異的クロマチン免疫沈降法によるゲノム機能発現調節機構の 生化学的解析

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  • 藤井 穂高
    弘前大学大学院医学研究科　ゲノム生化学講座

書誌事項

タイトル別名
  • Biochemical Analyses of Molecular Mechanisms of Regulation of Genome Functions Using the Locus-specific Chromatin Immunoprecipitation Technologies
  • イデンシザトクイテキ クロマチン メンエキ チンコウホウ ニ ヨル ゲノム キノウ ハツゲン チョウセツ キコウ ノ セイカガクテキ カイセキ

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説明

転写やエピジェネティック制御をはじめとするゲノム機能発現調節の分子機構の解明には，解析対象とするゲノ ム領域に結合している分子を同定することが必須である．筆者らのグループは，これを実現するための新規方法として 「遺伝子座特異的クロマチン免疫沈降法（遺伝子座特異的 chromatin immunoprecipitation（ ChIP） 法）」を開発してきた． 遺伝子座特異的ChIP 法は，細胞から分子間相互作用を保持したまま解析対象ゲノム領域を特異的に単離する生化学的技術であり，質量分析法 （mass spectrometry: MS） や次世代シークエンス法 （next-generation sequencing: NGS） などの手法と組み合わせることにより，当該ゲノム領域結合分子の網羅的同定が可能である．遺伝子座特異的ChIP 法は，insertional ChIP（ iChIP） 法とengineered DNA-binding molecule-mediated ChIP（enChIP）法から構成される．本稿では，遺伝子座特異的ChIP 法の基本原理や応用例について紹介する．

収録刊行物

  • 弘前医学

    弘前医学 69 (1-4), 10-18, 2019-03-15

    弘前大学大学院医学研究科・弘前医学会

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