書誌事項
- タイトル別名
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- Design of new universal PCR primers for detecting 18S rRNA genes of bacterivorous protozoa in the environment
- サイキン ホショクセイ ゲンセイ ドウブツ ノ 18S rRNA イデンシ オ ヒョウテキ ト シタ ユニバーサル PCR プライマー ノ セッケイ ト テキヨウ
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説明
細菌捕食性原生動物の18S rRNA遺伝子を標的としたqPCR用のユニバーサルプライマーを設計し，その有効性を検討した．18S rRNA遺伝子検出用のプライマーは，過去の18S rRNA遺伝子の塩基配列解析結果を基に，コンセンサス配列の部分を決定した上で設計した．18S rRNA遺伝子の開始点から 約500 basesの領域と約1000 basesの領域から，異なる2種類のqPCR用のプライマーペアを設計した．これら2種類のプライマーペアを使って，広瀬川河川水から抽出したDNAを対象にqPCRを行った．その結果，それぞれの18SrRNA遺伝子数の値が極めて近くなり，測定値は妥当であることが示唆された．また，16S rRNA遺伝子数も測定し，関連性を解析した結果，一定の範囲で比例関係にあることが分かった．
収録刊行物
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- 土木学会論文集Ｇ（環境）
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土木学会論文集Ｇ（環境） 74 (7), III_239-III_245, 2018
公益社団法人 土木学会
