光活性イエロータンパク質の光反応サイクルにおける<i>trans-cis</i>光異性化過程の量子的分子動力学シミュレーション解析

DOI Web Site 参考文献13件
  • 石田 賢亮
    早稲田大学先進理工学部化学・生命化学科, 〒169-8555 東京都新宿区大久保3-4-1
  • 西村 好史
    早稲田大学理工学術院総合研究所, 〒169-8555 東京都新宿区大久保3-4-1
  • 中井 浩巳
    早稲田大学先進理工学部化学・生命化学科, 〒169-8555 東京都新宿区大久保3-4-1 早稲田大学理工学術院総合研究所, 〒169-8555 東京都新宿区大久保3-4-1

書誌事項

タイトル別名
  • Quantum Molecular Dynamics Simulation for <i>trans-cis</i> Photoisomerization Process in Photocycle of Photoactive Yellow Protein

抄録

<p>This study focused on the trans-cis photoisomerization process of p-coumaric acid (pCA) in photoactive yellow protein (PYP), which is an initial step of the photocycle. Quantum molecular dynamics simulations for the whole PYP system were performed using the divide-and-conquer density functional tight-binding method. The hydrogen bond between Glu46 and pCA was clarified to be shorter than that of the initial structure, which hinders the hula-twist isomerization process for structures after passing through the conical intersection.</p>

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参考文献 (13)*注記

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