微小結晶を用いたタンパク質X線結晶構造解析におけるデータ処理システムの開発

DOI Web Site Web Site 参考文献29件
  • 山下 恵太郎
    国立研究開発法人理化学研究所放射光科学研究センター

書誌事項

タイトル別名
  • Development of X-ray Data Processing System for Protein Microcrystals
  • 学会賞受賞論文 微小結晶を用いたタンパク質X線結晶構造解析におけるデータ処理システムの開発
  • ガッカイショウ ジュショウ ロンブン ビショウ ケッショウ オ モチイタ タンパクシツ Xセン ケッショウ コウゾウ カイセキ ニ オケル データ ショリ システム ノ カイハツ

この論文をさがす

抄録

<p>The bottleneck in protein structure determination by X-ray crystallography is to obtain protein crystals with suitable size and sufficient diffracting power, and sometimes only microcrystals can be obtained. For such microcrystals, the use of X-ray microbeams is essential to collect diffraction data at high S/N ratio. However, radiation damage hampers complete and high-resolution data collection from a single microcrystal, and therefore multiple crystals are required. At microbeam beamline BL32XU, SPring-8, the workflow for protein microcrystals is established and automated. One of the key programs is SHIKA, which suggests microcrystal positions by finding diffraction spots from low-dose raster scan. Automatically collected datasets are processed and merged by KAMO, a new open-source data processing pipeline for automating the whole data processing tasks in the case of multiple datasets. These developments greatly facilitated the structure analyses from microcrystals.</p>

収録刊行物

参考文献 (29)*注記

もっと見る

キーワード

詳細情報 詳細情報について

問題の指摘

ページトップへ