タンパク質の立体構造を考慮したアミノ酸配列のマルチプルアライメント

黒岩 達雄, 大矢 雅則

タンパク質の立体構造を考慮したアミノ酸配列のマルチプルアライメント

被引用文献1件参考文献5件

黒岩達雄

東京理科大学理工学部情報科学科
大矢雅則

東京理科大学理工学部情報科学科

書誌事項

タイトル別名

On Multiple Alignment of Amino Sequences with Protein Structure

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説明

遺伝子レベルで生物の比較を行うためには, アミノ酸配列または塩基配列のアライメントが最初に行われなければならない.Needleman & Wunschがコンピュータによってアライメントを行うアルゴリズムを開発後さまざまな研究が行われてきた.本論文では, マルチプルアライメントの方法として, シミュレーテッドアニーリングをベースとして, アミノ酸の結合角度分布であるラマチャンドランプロットで表すタンパク質の立体構造を考慮した新たなアルゴリズムを提案する.