メモリ効率の良い<i>de novo</i>アセンブリアルゴリズム

書誌事項

タイトル別名
  • A Memory Efficient Short Read <i>De Novo</i> Assembly Algorithm

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説明

本論文では,次世代シーケンサから得られた大量のデータに対して,大規模なゲノムのアセンブリが可能となるように,消費メモリ量の少ない de novo アセンブリアルゴリズムを提案する.実験では,E. coli K-12 strain MG1655 及びヒトの 14 番染色体から得られたリードに対してアセンブリを行った.その結果,本手法は E. coli に対しては従来手法の約 20%,ヒト 14 番染色体に対しては他手法の約 60% の消費メモリ量で de novo アセンブリが可能であることを確認した.

収録刊行物

詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1572543027715080576
  • NII論文ID
    110009884011
  • NII書誌ID
    AA12055912
  • ISSN
    09196072
  • 本文言語コード
    ja
  • データソース種別
    • CiNii Articles

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