分子動力学法プログラムAMBERと Barnes-Hut tree code の並列化と性能評価

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タイトル別名
  • Parallelization and Performace Evaluation of MD Program AMBER and Barnes-Hut Tree Code

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説明

分子動力学シミュレーションのプログラムAMBERとBarnes-Hutのtree codeとを、分散メモリ型並列計算機SR2201上でMPI通信ライブラリを使って並列化し実行スピードの評価を行った。AMBERの実行速度は、AMBERのホームページで公表されている速度に比べて飛躍的に向上した。また、Barnes-Hut tree codeの実行速度は、独自の並列化手法によって目覚ましく加速した (128PUsで116倍、256PUsで170倍)。

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1573105977035976576
  • NII論文ID
    110002932069
  • NII書誌ID
    AN10463942
  • 本文言語コード
    ja
  • データソース種別
    • CiNii Articles

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