Gene coexpression data in COXPRESdb (RDF data)

メタデータ

公開日
2022-07-25
サイズ
  • COXPRESdb v8.1
DOI
  • 10.5281/zenodo.7252154
  • 10.5281/zenodo.7252155
公開者
Zenodo
データ作成者 (e-Rad)
  • Obayashi, Takeshi

説明

These are the gene coexpression data in Notation3 format, also provided in Virtuoso in COXPRESdb. Details of the data can be found on the download page in COXPRESdb. https://coxpresdb.jp/download/ Example: @prefix m2r: <http://med2rdf.org/ontology/med2rdf#> .<br> @prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .<br> @prefix dcterms: <http://purl.org/dc/terms/> .<br> @prefix obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/> .<br> @prefix ncbigene: <http://identifiers.org/ncbigene/> .<br> @prefix sio: <http://semanticscience.org/resource/> .<br> @prefix coxpresdb: <https://coxpresdb.jp/dataset/> .<br> @prefix coxpresdbo: <https://coxpresdb.jp/ontology/> .<br> @prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> . coxpresdb:Hsa-u.c4-0<br> dcterms:identifier "Hsa-u.c4-0" ;<br> dcterms:issued "2022-06-08"^^xsd:date . []<br> coxpresdbo:gene ncbigene:9 ;<br> coxpresdbo:gene ncbigene:10 ;<br> coxpresdbo:lsmr_score 6.33 ;<br> coxpresdbo:dataset coxpresdb:Hsa-u.c4-0 ;<br> a coxpresdbo:CoExpressedGenePair . []<br> coxpresdbo:gene ncbigene:41 ;<br> coxpresdbo:gene ncbigene:100 ;<br> coxpresdbo:lsmr_score 2.49 ;<br> coxpresdbo:dataset coxpresdb:Hsa-u.c4-0 ;<br> a coxpresdbo:CoExpressedGenePair .

キーワード

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