Development of functional SNPs of crops and its application for identification of useful genes
About this project
- Japan Grant Number
- JP23K23586
- Funding Program
- Grants-in-Aid for Scientific Research
- Funding organization
- Japan Society for the Promotion of Science
- Project/Area Number
- 23K23586
- Research Category
- Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Allocation Type
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- Multi-year Fund
- Single-year Grants
- Review Section / Research Field
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- Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
- Research Institution
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- Kazusa DNA Research Institute
- Project Period (FY)
- 2022-04-01 〜 2026-03-31
- Project Status
- Granted
- Budget Amount*help
- 17,290,000 Yen (Direct Cost: 13,300,000 Yen Indirect Cost: 3,990,000 Yen)
Research Abstract
総務省統計局で公表されている農作物や公共データベースにおいて遺伝子情報が公開されていない植物種について、ペプチドを含む遺伝子を高精度に予測し、ストレス耐性候補遺伝子を含むアノテーションを整備する。品種間SNPに対して遺伝子発現やタンパク質の活性といった情報を付与した機能的SNPを定義する。ホウレンソウにおけるキュウリモザイクウイルス抵抗性遺伝子座を同定し、機能的SNPを用いて候補遺伝子を絞り込み、相補性検定により機能的SNPの有用性を検証する。本研究で実施する多種多様な植物を対象とした機能的SNPを整備することで多様な作物における様々な形質に関わる原因遺伝子の解明に役立てることを目的とする。
Keywords
Details 詳細情報について
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- CRID
- 1040018351902446848
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- Text Lang
- ja
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- Data Source
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- KAKEN