作物の機能的SNP情報の整備および有用遺伝子同定への利用
研究課題情報
- 体系的番号
- JP23K23586
- 助成事業
- 科学研究費助成事業
- 資金配分機関情報
- 日本学術振興会(JSPS)
- 研究課題/領域番号
- 23K23586
- 研究種目
- 基盤研究(B)
- 配分区分
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- 基金
- 補助金
- 審査区分/研究分野
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- 小区分39010:遺伝育種科学関連
- 研究機関
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- 公益財団法人かずさDNA研究所
- 研究期間 (年度)
- 2022-04-01 〜 2026-03-31
- 研究課題ステータス
- 交付
- 配分額*注記
- 17,290,000 円 (直接経費: 13,300,000 円 間接経費: 3,990,000 円)
研究概要
総務省統計局で公表されている農作物や公共データベースにおいて遺伝子情報が公開されていない植物種について、ペプチドを含む遺伝子を高精度に予測し、ストレス耐性候補遺伝子を含むアノテーションを整備する。品種間SNPに対して遺伝子発現やタンパク質の活性といった情報を付与した機能的SNPを定義する。ホウレンソウにおけるキュウリモザイクウイルス抵抗性遺伝子座を同定し、機能的SNPを用いて候補遺伝子を絞り込み、相補性検定により機能的SNPの有用性を検証する。本研究で実施する多種多様な植物を対象とした機能的SNPを整備することで多様な作物における様々な形質に関わる原因遺伝子の解明に役立てることを目的とする。