KaPPA-View4: 代謝経路マップによるオミクスデータ解析ツールの最新バージョン

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タイトル別名
  • KaPPA-View4: The newest version of the tool for integration of transcriptome and metabolome on metabolic pathway maps

抄録

代謝制御に関与する遺伝子機能の解明を加速するため、我々はこれまでに、トランスクリプトームとメタボロームのデータを代謝経路マップ上で統合解析するためのウェブツールKaPPA-Viewを開発してきた。本発表では、最近リリースした最新バージョンであるKaPPA-View4について報告する。<br>1）劇的な処理速度の向上：内部データを全面的に見直し、すべてのステップでほとんどストレスのない解析環境を実現した。<br>2）Macintoshへの対応：マップ描画においてSVGプラグインのインストールが不要となったため、Windows, Macintosh, Linuxのいずれからも、解析が行えるようになった。<br>3）ユーザーマップの利用：フリーの描画ソフトInkscapeを使ってユーザーが任意に作成したマップを用い、解析が可能になった。<br>4）外部システムからのビューワーとしての利用：ホームページ上でのログイン操作を経ずに、外部データベースやアプリケーションから直接データをアップロードしてその結果をマップ上で表示できる機能を設けた。これにより、トランスクリプトームデータを蓄積しているデータベース等の開発者は、KaPPA-View4を外部ビューワーとして直接利用し、蓄積したデータをマップ上に表示させることができるようになった。<br>KaPPA-View4: kpv.kazusa.or.jp/kpv4/

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001205631004032
  • NII論文ID
    130006991986
  • DOI
    10.14841/jspp.2010.0.0169.0
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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