KaPPA-View4: 代謝経路マップによるオミクスデータ解析ツールの最新バージョン
書誌事項
- タイトル別名
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- KaPPA-View4: The newest version of the tool for integration of transcriptome and metabolome on metabolic pathway maps
説明
代謝制御に関与する遺伝子機能の解明を加速するため、我々はこれまでに、トランスクリプトームとメタボロームのデータを代謝経路マップ上で統合解析するためのウェブツールKaPPA-Viewを開発してきた。本発表では、最近リリースした最新バージョンであるKaPPA-View4について報告する。<br>1)劇的な処理速度の向上:内部データを全面的に見直し、すべてのステップでほとんどストレスのない解析環境を実現した。<br>2)Macintoshへの対応:マップ描画においてSVGプラグインのインストールが不要となったため、Windows, Macintosh, Linuxのいずれからも、解析が行えるようになった。<br>3)ユーザーマップの利用:フリーの描画ソフトInkscapeを使ってユーザーが任意に作成したマップを用い、解析が可能になった。<br>4)外部システムからのビューワーとしての利用:ホームページ上でのログイン操作を経ずに、外部データベースやアプリケーションから直接データをアップロードしてその結果をマップ上で表示できる機能を設けた。これにより、トランスクリプトームデータを蓄積しているデータベース等の開発者は、KaPPA-View4を外部ビューワーとして直接利用し、蓄積したデータをマップ上に表示させることができるようになった。<br>KaPPA-View4: kpv.kazusa.or.jp/kpv4/
収録刊行物
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- 日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集
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日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集 2010 (0), 0169-0169, 2010
日本植物生理学会
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詳細情報 詳細情報について
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- CRID
- 1390001205631004032
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- NII論文ID
- 130006991986
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- データソース種別
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- JaLC
- CiNii Articles
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- 抄録ライセンスフラグ
- 使用不可