トマトcDNAデータベース： MiBASEおよびKaFTom

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タイトル別名
  • cDNA Databases of Tomato: MiBASE and KaFTom

抄録

本研究では, トマト（Solanum lycopersicum）の矮性品種マイクロトムに由来するcDNAリソースの解析とデータベースの整備を進めている.<br> 9つのマイクロトムcDNAライブラリーに由来するESTと公開されているトマトESTよりUnigene（KTU; Kazusa Tomato Unigene）を構築し, KTUの配列および機能アノテーション等の情報をMiBASE（http://www.pgb.kazusa.or.jp/mibase/）から提供している. 現在提供しているKTU3（KTU ver. 3）は, 計322,795個のESTから構築した76,276個のUnigeneから構成される.<br> また, 4つのマイクロトム完全長cDNAライブラリーから, 13,227個のHTC（High Throughput cDNA）が得られている. これらHTCに対して, 機能と構造のアノテーションを付加し, その情報をKaFTom（http://www.pgb.kazusa.or.jp/kaftom/）から提供している.<br> 現在, これらのデータベースを統合したTOMATOMICSを構築中である.<br>[謝辞] 本研究は, ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）のサポートを受け, 佐藤忍先生（筑波大学）および有江力先生（東京農工大）の協力のもと, 実施されている.

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詳細情報 詳細情報について

  • CRID
    1390001205631083392
  • NII論文ID
    130006992100
  • DOI
    10.14841/jspp.2010.0.0729.0
  • データソース種別
    • JaLC
    • CiNii Articles
  • 抄録ライセンスフラグ
    使用不可

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