上流転写制御因子を同定する新技術の開発
書誌事項
- タイトル別名
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- Development of new methods to identify transcription factors that interact with promoter region
抄録
個々の遺伝子の発現を制御している転写制御因子を同定するには、酵母ワンハイブリッド法がよく用いられる。これには、まず対象遺伝子のプロモーター解析を行ってシスエレメントを絞り込み、これらを上流領域に複数個連結したリポーター遺伝子を用いて、これに結合する転写因子をcDNAライブラリーからスクリーニングするのが一般的である。しかし成功するかどうかはライブラリーのクオリティに依存するところが大きく、またcDNAライブラリーの8割以上は転写因子以外の遺伝子で構成されているため、大規模なスクリーニングが必要であるなどの問題点も多い。そこで本研究では、転写因子のcDNAのみからなるライブラリーを作成することで、このような問題点がどの程度解決できるか検討した。その結果、線虫などでの先例と同様に、シスエレメントの絞り込みを行うことなしに、500-1000bpのプロモーター領域をそのまま用いた場合でも、従来法より100倍以上の高効率で目的の転写制御因子を同定することができた。しかし酵母を用いた方法は、偽陽性や偽陰性を生じやすいこともわかり、植物を利用した新しい方法も検討している。本発表ではこれらの方法を比較検討した結果を報告したい。
収録刊行物
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- 日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集
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日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集 2010 (0), 0167-0167, 2010
日本植物生理学会
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詳細情報 詳細情報について
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- CRID
- 1390282680607715840
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- NII論文ID
- 130006991988
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- データソース種別
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- JaLC
- CiNii Articles
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- 抄録ライセンスフラグ
- 使用不可